La juridiction de Rauzan se compose alors de douze paroisses, dont Saint-Vincent-de-Pertignas et Saint-Jean-de-Blaignac, situés sur le canton actuel de Pujols. En 1639, cette juridiction passe de la sénéchaussée de Bazas à celle de Libourne nouvellement créée par Louis XIII. Cependant, pendant la Fronde, le pays rauzannais est tellement ravagé qu’il ne peut assurer la subsistance des troupes.
Le château perd sa vocation de place forte et devient un château de résidence. Aux mains des Durfort de Duras à partir de 1480, le château est progressivement abandonné. La partie nord s'écroule en 1845.
A l'état de ruine au début du XIXe siècle, le château devient la propriété des Chastellux en 1819. Classé monument historique en 1862, il est acheté par la commune de Rauzan en 1900, il ne renaîtra réellement dans les esprits qu’à partir des années 1970 lorsque la Commune et quelques passionnés entreprennent des travaux de débroussaillage et de restauration.
En 1980, la barbacane devant la porte d'entrée a été en partie restaurée. Depuis 2005, le château connait de multiples campagnes de restauration qui conduisent de temps à autre à sa fermeture au public.
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